Các chi phí áp dụng trong khu công nghiệp được quy định như sau:

• Phí quản lý và bảo trì hạ tầng: 0,5 USD/m²/năm

• Tiền thuê đất thô (hàng năm): Thực hiện theo mức giá do UBND tỉnh Thừa Thiên Huế ban hành

• Giá điện: Dao động từ 0,03 – 0,1 USD/kWh, tùy theo khung thời gian sử dụng

• Giá nước: 0,4 USD/m³

• Phí xử lý nước thải: 0,28 USD/m³, trong đó lượng nước thải được tính bằng 80% tổng lượng nước tiêu thụ

Khu Công nghiệp VSIP II Quảng Ngãi nằm trong Khu Kinh tế Dung Quất, vì vậy các nhà đầu tư được hưởng đầy đủ các chính sách ưu đãi theo quy định áp dụng cho khu kinh tế. Cụ thể:

• Ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp:
  Doanh nghiệp được miễn thuế trong 4 năm đầu kể từ khi có thu nhập chịu thuế, sau đó được giảm 50% số thuế phải nộp trong 9 năm tiếp theo. Mức thuế suất ưu đãi áp dụng là 10% trong thời hạn 15 năm.
• Ưu đãi thuế nhập khẩu:
  Miễn thuế đối với hàng hóa nhập khẩu nhằm tạo tài sản cố định cho dự án. Đồng thời, nguyên liệu, vật tư và bán thành phẩm trong nước chưa sản xuất được, khi nhập khẩu phục vụ hoạt động sản xuất, sẽ được miễn thuế trong vòng 5 năm kể từ khi dự án đi vào vận hành.